Nach dem Ende von seiner Karriere als Spieler bei der ersten Meisterschaft von „Mainz“ im Jahr 2007 begann Ulli seine Karriere als Trainer mit den „Athletics“. Wermuth arbeitete mit den Jugendmannschaften und im Jahr 2011 übernahm er den Posten des Managers vom Bundesliga-Team.

Wermuth spielte eine große Rolle bei der Gründung von Rhein Main Baseball Academy. Ulli arbeitete mit der Deutschen Baseball-Akademie (DBA) und seit vielen Jahren trainierte er die Jugendmannschaften des Landesverbandes. Er gewann acht Titel mit dem Verein, vier als Spieler und vier als Trainer. In der deutschen Baseball-Bundesliga hatte er als Trainer einen 112-61 Rekord. Im Jahr 2016 schlugen „Athletics“ die „Buchbinder Legionäre Regensburg“ in vier Spielen und gewannen ihren zweiten nationalen Titel.

Beide Seiten konnten keine Einigung erzielen, um einen neuen Vertrag auszuhandeln, so wurde Wermuth gezwungen, seinen Vertrag aufzulösen. „Ich habe meine Leidenschaft in einen Beruf „verwandelt“, so würde ich gerne weiter im Baseball arbeiten. Aber zuerst werde ich mich eine Auszeit nehmen. Ich kann es kaum erwarten, dieser Sommer mit meiner Familie zu verbringen. Ich danke den „Mainz Athletics“ und, natürlich, bleiben wir gute Freunde“, – sagte Ulli Wermuth.